Prueba de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) de Infecciones de las Vías Urinarias por E.coli Uropatógena

Tema: Perfil global de expresión génica y susceptibilidad a los antibióticos después de la exposición repetida a la molécula-2 liberadora de monóxido de carbono (CORM-2) en Escherichia coli uropatogénica productora de ESBL multirresistente
Objetivo: Identificar varias ontologías de genes enriquecidos, vías modificadas y genes únicos que son blanco de CORM-2 en un dispositivo multirresistente.
Muestra: Dos cepas clínicas de UPEC, el aislado de E. coli productor de BLEE (ESBL7) y el aislado de producción de ESBL UPEC2
Ácido Núcleico: ADN, ARN
Genes: ibpB
            marAB, mdtABC
            kpsC, fepCEG, entABE
PCR: PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR)
40 ciclos
D: 95 ° C 15 min
H: 60 ° C 30 seg
E: 72 ° C  30 seg
Visualización: EFO

Fig. 5. Multiplex PCR de genes fimbriales utilizando cDNA de E. coli CFT073 cultivado en orina o LB como plantilla. (A) PCR multiplex de transcriptos de focH, c1936, c2395, ppdD y papA de bacterias aisladas al principio (carriles 4, 8, 12 y 16), medio (carriles 5, 9, 13 y 17), y tardía Fase exponencial (carriles 6, 10, 14 y 18), así como la fase estacionaria (carriles 7, 11, 15 y 19). NTC, control sin plantilla; positivo Control del ADN genómico. (B) PCR de yadN (carriles 2 a 9) y multiplex PCR de yehA, aufA, ygiL, yfcV, y papA (carriles 10 a 20) transcripciones de bacterias aisladas temprano (carriles 2, 6, 13 y 17), media (carriles 3, 7, 14 y 18), y fase exponencial tardía (carriles 4, 8, 15 y 19), así como la fase estacionaria (carriles 5, 9, 16 y 20).

Bibliografía:
1.  Sahlberg Bang C, Demirel I, Kruse R, Persson K. Global gene expression profiling and antibiotic susceptibility after repeated exposure to the carbon monoxide-releasing molecule-2 (CORM-2) in multidrug-resistant ESBL-producing uropathogenic Escherichia coli. Saraiva LM, editor. PLoS One [Internet]. 7 de junio de 2017 [citado 11 de noviembre de 2018];12(6):e0178541. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28591134